Baquedano est l'une des communes qui composent la municipalité d'Améscoa Baja, dans le vaste couloir naturel qui s'ouvre entre la chaîne montagneuse d'Urbasa et celle de Lóquiz. Situé à 654 mètres d'altitude, sur la rive gauche de l'Urederra, le village se niche au pied de l’impressionnante crête calcaire d’Urbasa et occupe une position stratégique en tant que porte d’entrée de la réserve naturelle de la source de l’Urederra, l’un des espaces naturels les plus emblématiques de Navarre.
Le centre-ville conserve un vaste hameau comptant de nombreuses maisons blasonnées des XVIe et XVIIe siècles, liées à des lignées telles que les Andueza, les Azpilicueta, Urra ou encore les Baquedano eux-mêmes, dont le nom de famille est attesté dans la vallée depuis l’époque médiévale et apparaît déjà cité dans le Fuero d’Intzura en 1201. Sur le plan religieux, on remarque l’église paroissiale Saint-Jean-Baptiste, de style gothique tardif du XVIe siècle, qui conserve une sculpture également de style gothique tardif représentant le saint patron, ainsi que l’ermitage de la Sainte-Croix, de style baroque, situé sur un site surélevé offrant une vue imprenable sur la vallée. Derrière l’église se trouve le palais d’Andueza, un exemple remarquable d’architecture civile nobiliaire.
Le cadre naturel définit l’identité de Baquedano. C’est depuis le village même que part l’itinéraire menant à la source de l’Urederra, déclarée réserve naturelle en 1987 et intégrée depuis 1997 au parc naturel d’Urbasa et d’Andía. Il s’agit du principal exutoire de l’aquifère d’Urbasa, avec un débit annuel moyen de 4 500 litres par seconde qui peut être multiplié après de fortes pluies. Le parcours balisé de neuf kilomètres aller-retour traverse une forêt dominée par les hêtres, accompagnés d’ormes de montagne, de frênes, de tilleuls, de sorbiers, d’érables, de noisetiers et de buis, jusqu’à atteindre les bassins et les cascades aux eaux turquoise qui ont fait de l’Urederra un site paysager emblématique. La richesse faunistique comprend des espèces rupicoles telles que le vautour, le vautour percnoptère ou le milan royal.
Outre la source, la commune conserve des vestiges du village médiéval abandonné d’Amescoazarra-Inzura, ancienne forteresse datant d’avant 1300 située sur un promontoire de la vallée, où l’on peut distinguer des restes de remparts et des traces d’habitations. Tout cela renforce la valeur historique et stratégique qu’a eue Baquedano au fil des siècles.